МУЛЬТИЛОКУСНОЕ VNTR-ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ FRANCISELLA TULARENSIS

Аннотация:

При анализе генома Francisella tularensis с помощью авторских программ «DNA» выявлено большое количество локусов, содержащих тандемные повторы. Для анализа были отобраны 3 из них, обозначенные нами как FtA, FtB и FtC. При исследовании ДНК 40 штаммов рода Francisella в ПЦР со специфическими праймерами к этим локусам установлена большая изменчивость числа повторов, причем при анализе локуса FtA выявлено наличие 17 аллелей, FtB—5 аллелей, FtC — 5 аллелей. Исследуемые штаммы сгруппированы в 24 варианта генотипов, частота встречаемости которых варьировала от 0,025 до 0,125. Учитывая вариабельность выявленных локусов и большое количество потенциальных локусов VNTR в геноме, дальнейшая разработка данного метода будет способствовать созданию локальных и общей баз данных штаммов, что обеспечит более эффективное генотипирование возбудителя туляремии.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2004
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2004.-N 2.-С.21-25
Просмотров: 72