КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ИНВЕРТИРОВАННЫХ ПОВТОРОВ В ГЕНОМЕ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА

Аннотация:

Для изолятов медленно растущих микобактерий М. tuberculosis с полностью секвенированным геномом H37Rv и CDC1551 определены термодинамически стабильные инвертированные повторы, которые могут стабилизировать иРНК от воздействия нуклеаз. Геном лабораторного штамма H37Rv может содержать 50 шпилечных структур, образованных инвертированными повторами, длина стебля которых варьирует от 11 до 28 пар нуклеотидов (п.н,), размер петли составляет 4 — 5 нуклеотидов. В геноме клинического изолята CDC1551 с высоким уровнем вирулентности содержится 47 шпилек. В геноме CDC1551, в отличие от H37Rv, на 5'-конце локализована высокостабильная шпилька длиной 58 нуклеотидов. Возможность образования шпилек с длиной стебля 11 п.н. и более подтверждена визуализацией с помощью атомно-силовой микроскопии. Обсуждается возможность участия вторичных структур, образованных шпильками, для защиты иРНК медленно растущих патогенов М. tuberculosis от деградирующей активности РНКаз.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2004
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2004.-N 5.-С.48-52
Просмотров: 50