МУЛЬТИЛОКУСНЫЙ VNTR-АНАЛИЗ В ИЗУЧЕНИИ ПОПУЛЯЦИОННОЙ СТРУКТУРЫ YERSINIA PESTIS В ПРИРОДНЫХ ОЧАГАХ

Аннотация:

Коллекция штаммов Yersinia pestis исследована методом мультилокусного VNTR-анализа. Все 9 использованных локусов являлись полиморфными, хотя и различались между собой по числу генотипов, обнаруживая во взятой выборке от 4 до 13 генотипических вариантов. Индекс полиморфизма (DI) варьировал от 0,18 (ms21) до 0,86 (ms46), 8 локусов имели DI > 0,5. При статистической обработке обнаружено 55 индивидуальных генотипов в группе из 81 исследованного штамма, что свидетельствует о высокой дискриминационной возможности системы типирования (DP = 0,98). Кластерным анализом генотипы разделены на 11 основных групп. Установлено, что штаммы, принадлежащие к одной генотипической группе, как правило, происходят из одного природного очага. Предложенная схема типирования и созданная база данных генотипов возбудителя чумы позволяют с высокой долей вероятности установить источник происхождения штаммов.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2004
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2004.-N 4.-С.19-28
Просмотров: 113