MIRU-VNTR-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ: СЕМЕЙСТВО BEIJING ПРОТИВ KILIMANJARO

Аннотация:

Проведено изучение 72 штаммов М. tuberculosis, выделенных от больных из различных районов Восточной Сибири, по минисателлитным повторам MIRU-VNTR. Построены филогенетические древа взаимоотношений между исследуемыми штаммами и штаммами из других регионов мира методами филогенетического анализа — NJ, UPGMA и ML. Приводятся филогенетические доказательства преобладания (71%) семейства Beijing и Beijing-подобных штаммов в регионе. Кроме того, обнаружена группа штаммов (11%) с устойчивым генотипом, названная ASU (африкано-сибирско-уральской). Как доминирующий признак группы ASU выделено сцепление между локусом MIRU 10 (5—10 повторов) и MIRU 26 (единственный повтор). По предварительным данным, помимо Восточной Сибири, штаммы группы ASU встречаются на Урале и в Африке (Танзания, генотип — Kilimanjaro). MIRU-консенсус группы ASU для Восточной Сибири 22(>6) 225113222.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2004
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2004.-N 4.-С.33-38
Просмотров: 73