МОЛЕКУЛЯРНОЕ ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В ЦЕНТРАЛЬНОЙ РОССИИ: ЭФФЕКТИВНОСТЬ СПОЛИГОТИПИРОВАНИЯ И VNTR-MIRU

Аннотация:

В статье рассматриваются актуальные вопросы молекулярной эпидемиологии штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Самарской области России. С использованием двух методов, основанных на применении ПЦР, проведено генотипирование 190 изолятов М. tuberculosis, выделенных от больных различными формами легочного туберкулеза в гражданских и тюремном противотуберкулезных учреждениях Самарской области. На основании статистической обработки результатов с применением индекса Хантера—Гастона проведено сравнение разрешающей способности методов сполиготипирования и вариабельных длин тандемных повторов (VNTR-MIRU) с использованием 15 локусов для генотипирования микобактерий в популяции с высокой распространенностью штаммов семейства Beijing (67,9%). Показана более высокая эффективность и разрешающая способность метода VNTR-MIRU (индекс 0,747) по сравнению с методом сполиготипирования (индекс 0,572). Наибольшим полиморфизмом характеризовались локусы VNTR-MIRU 10, 26, 31, 39, 40 и ETR-A, что позволяет рекомендовать их для скрининговых исследований, в том числе с применением электрофоретической регистрации результатов без использования автоматических секвенаторов генов.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2005
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2005.-N 4.-С.9-14
Просмотров: 86