ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ШТАММОВ И ИЗОЛЯТОВ РЕОВИРУСА КУР С ПОМОЩЬЮ ПЦР И АНАЛИЗА ПОДВИЖНОСТИ ГЕТЕРОДУПЛЕКСОВ АМПЛИФИЦИРОВАННОЙ кДНК

Аннотация:

На основе сочетанного метода обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР) и анализа подвижности гетеродуплексов кДНК в полиакриламидном геле разработан метод дифференциации штаммов и изолятов реовируса кур. С помощью ОТ-ПЦР амплифицированы кДНК участка генома 633—896 п. н. (длина ампликона 263 п.н.) гена S3 вакцинных штаммов и изолятов реовируса кур, выделенных на территории центральной части РФ и Италии. Проведен сравнительный анализ подвижности гетеродуплексов амплифицированных проб кДНК. Выведено уравнение линейной регрессии и построен график регрессионной кривой (у = 91,726 — О,89х, где у — уровень нуклеотидных отличий (в %), х — относительная подвижность гетеродуплекса (в %)), отражающие зависимость подвижности гетеродуплексов от уровня нуклеотидных отличий молекул кДНК, формирующих гетеродуплекс. Данный метод дифференциации применим при уровне нуклеотидных отличий кДНК, превышающем 2,7%.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2006
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2006.-N 1.-С.28-31
Просмотров: 44