РАСПОЛОЖЕНИЕ МАТРИЦЫ В ОБЛАСТИ ДЕКОДИРОВАНИЯ РИБОСОМ ЧЕЛОВЕКА ПО ДАННЫМ ФОТОАФФИННОЙ МОДИФИКАЦИИ АРИЛАЗИДОПРОИЗВОДНЫМИ ОЛИГОРИБОНУКЛЕОТИДОВ

Аннотация:

Для изучения расположения матрицы в декодирующем центре 80S рибосом человека применена фотоаффинная модификация рибосом аналогами мРНК - производными олигорибонуклеотидов, состоящими из двух различных кодонов и несущими арилазидогруппу на 5'-фосфате. Использованы три последовательности: pUUUGUU (кодоны Phe и Val), pUUCUAAA (кодон Phe и стоп-кодон) и pGUGUUU (кодоны Val и Phe). При модификации расположение кодонов матрицы в А- и Р-сайтах или в Р- и Е-сайтах рибосомы регулировали с помощью родственных тРНК. Во всех случаях модифицировались практически только 40S субчастицы. Во всех модельных состояниях все три аналога мРНК сшивались с 18S рРНК практически в единственном сайте, а именно с нуклеотидом G-1207. Наборы модифицированных белков были идентифицированы для производного PGUGUUU. В отличие от модификации рРНК, модификация белков существенно зависела от типа комплекса. В случае, когда деацилированная тРНК^ находилась в Е-сайте, а Phe-тРНК"^ в Р-сайте, аналог мРНК сшивался в основном с белками S6 и S26; когда Val-тРНК^ направляли в Р-сайт, а Phe-тРНК^ - в А-сайт, в большей степени модифицировались белки S2 и S6 (в меньшей степени - S26). Такие же результаты были получены при наличии единственной Phe-тРНК"^ в Р-сайте. Наконец, при наличии единственной Val-тРНК^' в Р-сайте модифицировался в основном белок S2. Проведено сопоставление результатов с данными, полученными в аналогичных комплексах 80S рибосом с производным pGUGUUU, несущим алкилирующую группу на 5'-фосфате.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 1с.
Дополнительная информация: 1998.-N 2.-С.364-364
Просмотров: 16