НУКЛЕОТИДНАЯ И АМИНОКИСЛОТНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА ПЕКТИНА И КОДИРУЕМОГО ИМ БЕЛКА У ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РАЗЛИЧНЫХ ТРИБ СЕМЕЙСТВА БОБОВЫХ И СПЕЦИФИЧНОСТЬ ИХ УЗНАВАНИЯ МИКРОСИМБИОНТОМ ПРИ ФОРМИРОВАНИИ БОБОВО-РИЗОБИАЛЬНОГО СИМБИОЗА

Аннотация:

Одним из критических моментов становления бобово-ризобиального симбиоза является стадия "узнавания" микроорганизмом растения-хозяина. Не последняя роль в этом процессе принадлежит растительным пектинам, взаимодействующим с экзополисахаридами клубеньковых бактерий и обеспечивающим его родо-, видо- и штаммоспецифичность. В связи с этим сравнительный анализ аминокислотной последовательности лектинов различных видов бобовых растений и, в частности, углеводсвязывающей части молекулы пектина представляет значительный интерес. С использованием компьютерного анализа выбраны довольно консервативные участки гена пектина, фланкирующие вариабельную углеводсвязывающую область, к которым были синтезированы олигонуклеотидные праймеры. Проведена амплификация участка гена пектина протяженностью около 280 п.н. ряда видов бобовых растений, относящихся к нескольким трибам, и определены их нуклеотидные последовательности. Компьютерный анализ фрагмента гена пектина бобовых растений с помощью пакета прикладных программ Lasergene позволил построить филогенетическое древо исследуемых видов, отражающее их родственные и эволюционные взаимоотношения, и предсказать аминокислотные последовательности данного участка молекулы лектина. Наибольшей вариабельностью характеризуется именно углеводсвязывающий участок с консенсусной последовательностью аминокислот TrpAspProXxxXxxXxxArgHis, в котором сосредоточено большинство как замен, так и делеций и вставок аминокислот. В то же время такие близкие виды, как астрагал и остролодочник, вступающие в симбиоз с почвенными бактериями вида Rhizobium loti, имеют 100%-ную гомологию этого участка, а например, имеющиеся замены у донника по сравнению с люцерной (узнаваемых R. теliloti) касаются подобных аминокислот и скорее всего не носят функционального характера. Таким образом, выявляемая высокая гомология углеводсвязывающего участка молекулы лектина некоторых бобовых растений в какой-то степени объясняет узнавание этих макросймбионтов ризобиями, относящимися к одному виду.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 1с.
Дополнительная информация: 1998.-N 2.-С.383-383
Просмотров: 51