СТРУКТУРНЫЕ ОСНОВЫ КАТАЛИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ Serratta marcescens

Аннотация:

Проведено рентгеноструктурное исследование атомной структуры с разрешением 1.7А внеклеточной эндонуклеазы Serratia marcescens (мол. масса 26700 Да). Качество уточнения строения молекулы характеризуется R = 17.3%, R^ = = 22.2%. Найдены значительные отличия вторичной структуры нуклеазы при этом разрешении по сравнению с ранее известными данными. Изучены каталитические свойства нуклеазы S. marcescens. Она является металл-зависимым сахар-неспецифичным ферментом и расщепляет 3'-0-Р-связи одно- и двухспиральных ДНК и РНК с образованием 5'-фосфорилированных олигонуклеотидов. Проведен анализ функциональных свойств ряда мутантных производных нуклеазы и анализ аминокислотных последовательностей гомологичного семейства белков. Локализованы каталитически важные консервативные остатки в пространственной структуре активного центра фермента. Предложен химический механизм функционирования нуклеазы Serratia, в котором карбоксильная и имидазольная группы остатков нуклеазы Glu-127 и His-89 выступают соответственно в качестве общего основания и кислоты, а гуанидиновые группы остатков Arg-87/131 нейтрализуют дополнительный отрицательный заряд пентакоординированного атома фосфора в переходном состоянии, стабилизируемого также ионом Mg^, связанным с остатками Asp-86/128.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 1с.
Дополнительная информация: 1998.-N 2.-С.383-383
Просмотров: 32