СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА АДЕНОВИРУСА ПТИЦ EDS-76. СЕКВЕНИРОВАНИЕ И АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ФРАГМЕНТА ВИРУСНОЙ ДНК (0-10.6%)

Аннотация:

Получена плазмидная экспрессирующая клонотека ДНК аденовируса птиц EDS-76. С помощью иммунологического скрининга с поликлональными антителами морской свинки к очищенному и разрушенному вирусу обнаружены клоны, экспрессирующие гены антигенов EDS-76. Компьютерный анализ нуклеотидной последовательности ДНК шести антиген-позитивных клонов с помощью программы BLAST выявил высокую локальную гомологию аминокислотных последовательностей, кодируемых этими клонами, с последовательностями структурных белков 28 кДа, pVII, pVI, отростка, а также белков 52/55 и 100 кДа аденовируса овец OAV287. С помощью гибридизации по Саузерну ДНК EDS-76 с рекомбинантными плазмидами определено положение клонированных фрагментов в reноме аденовируса. Нуклеотидная последовательность левого концевого фрагмента (0-10.6%) генома EDS-76 содержит гены малого и большого Т-антигенов, ген белка 31.8 кДа - аналога нового структурного белка 28 кДа аденовируса овец OAV287 и С-концевую часть белка IVa2. Геномная организация области Е1 у аденовируса птиц EDS-76 и аденовируса овец OAV287 сходна, но отличается от организации области Е1 известных аденовирусов человека и животных, а также от предполагаемой области Е1 аденовируса птиц FAVI (CELO). Аденовирус птиц EDS-76 (egg drop syndrome virus), относимый к семейству Adenoviridae, вызывает снижение яйценоскости у кур-несушек и по ряду свойств отличается от других аденовирусов птиц: 1) он имеет широкий круг хозяев, сыворотка многих видов птиц содержит антитела против этого вируса, 2) у EDS-76 отсутствуют общие с другими аденовирусами птиц антигенные детерминанты, 3) геном EDS-76 (34 т.п.н.) значительно меньше геномов других известных аденовирусов птиц группы FAV (43.8 т.п.н.) [1], 4) в отличие от аденовирусов птиц группы FAV, у EDS-76 с основанием пентона связан один отросток, а не два [2]. Данные по структурно-функциональной организации генома EDS-76 ограничены - существует физическая карта для нескольких рестриктаз [35], и по результатам гибридизации ДНК EDS-76 с фрагментом генома аденовируса крупного рогатого скота BAV3, содержащим онкоген [5], определена ориентация генома. В последнее время появились первые данные по секвенированию гена вирусной протеазы [6] и генов основания пентона и белка pVni [7]. В настоящей работе поставлена задача более детального изучения структурно-функциональной организации генома EDS-76 с целью использования в дальнейшем данного вируса в качестве эукариотического вектора.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 1998.-N 3.-С.420-426
Просмотров: 67