БЕЛКОВОЕ ОКРУЖЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 609-618 РАЙОНА <530 stem-loop> 18S рРНК В 40S СУБЧАСТИЦАХ РИБОСОМ ЧЕЛОВЕКА

Аннотация:

Изучено связывание шести коротких ДНК-зондов, комплементарных различным участкам района 595-642 18S рРНК. ("530 stem-loop"), с 40S субчастицами рибосом человека. Установлено, что только олигодезоксирибонуклеотиды (ON), комплементарные участкам 601-611 (ONI) и 609-618 (ON2), способны связываться достаточно эффективно. На основе ON2 синтезировано производное, содержащее фотоактивируемую арилазидогруппу на 5'-конце, которое специфически сшивалось с 40S субчастицами. С помощью аналогичного производного rON, соответствующего ON2, установлено, что основными мишенями модификации являлись рибосомные белки S3 и S5. Эти же белки подвергались модификации, когда 40S субчастицы находились в комплексах с поли(и) или с поли(и) и PheтРНК^. Сделан вывод, что белки S3 и S5 расположены в 40S субчастицах рибосом человека вблизи С-61818S рРНК. Известно, что высококонсервативный район 16S рРНК Е. соИ, включающий нуклеотиды 500556, обладает характерной шпилечной структурой и имеет устоявшееся название "530 stemloop". В 18S рРНК человека этому району соответствует участок 595-642 [1). Существует много данных, свидетельствующих о том, что этот район 16S рРНК расположен вблизи декодирующего участка рибосомы и играет важную роль в процессе трансляции. Например, установлено, что в присутствии молекулы тРНК, связанной в А-сайте рибосомы, основания G-529, G-530 и U-531 защищены от модификации [2]. Мутации по основанию G-530 препятствуют образованию полисом [3], замена G-530 на А приводит к нарушению EFТи-зависимого связывания аминоацил-тРНК с рибосомами [4], а мутации по основанию G-517 нарушают рамку считывания мРНК [5). Наконец, существуют данные, свидетельствующие о тесных контактах матрицы с А-532 16S рРНК {( >, 71. Однако данные, полученные на рибосомах прокариот, не могут быть полностью перенесены на рибосомы высших организмов, поскольку механизм трансляции у эукариот более сложен, и имеются существенные различия в структурах про- и эукариотических рибосом. О расположении и функциональной роли участка "530 stemloop" на рибосомах эукариот известно довольно По данным сшивок синтетических матриц, несущих остатки 4-тиоуридина, с 80S рибосомами человека [8,9), известно, что U-630 18S рРНК, соответствующий остатку А-532 в 16S рРНК Е. соИ, тесно контактирует с мРНК. Наконец, до сих пор не определено расположение многих белков в составе эукариотической рибосомы, поскольку методы реконструкции рибосом (часто необходимые для такого определения) отсутствуют.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 1998.-N 3.-С.452-459
Просмотров: 20