ВЫЯВЛЕНИЕ РОЛИ ДИВЕРГЕНЦИИ В ЭВОЛЮЦИИ ФАГОВ-ТРАНСПОЗОНОВ ГРУППЫ В3 Pseudomonas aeruginosa

Аннотация:

Для выявления и картирования дивергированных последовательностей ДНК в геноме фагов-транспозонов (ФТ) группы ВЗ P. aeruginosa проведен гетеродуплексный анализ с использованием различных концентраций формамида (30, 50 и 70%). Шесть ФТ были классифицированы в три родственных вида: ВЗ, РМ681 и РМ57. В эволюции ФТ одного вида роль дивергенции незначительна. Так, геномы фагов РМ105 и РМ681 (вид РМ681) и фагов Hwl2 и РМ57 (вид РМ57) содержат либо гомологичную ДНК (98%), либо негомологичную ДНК (2%). В геноме ФТ разных видов выявлены гомологичные, дивергированные и негомологичные участки ДНК (модули). Гомологичные модули с уровнем гомологии ДНК выше 86% составляют около 30% генома фагов, они локализовань1"на левом (1-5 тпн) и правом (29-38 тпн) концах генома фагов. Дивергированные модули с уровнем гомологии ДНК 5067% и негомологичные модули представляют соответственно 30-35 и 25-30% размера генома. Эти участки образуют мозаичную структуру в области 5-29 тпн. Таким образом, показана ключевая роль дивергенции в эволюции природных ФТ трех родственных видов группы ВЗ. Интересно, что единственный участок с дивергированной последовательностью ДНК, обнаруженный в геноме фага РМ62 (вид РМ57, координаты 5-1 1 тпн), был включен в состав данного фага в результате межвидовой рекомбинации с фагом вида ВЗ, как это было показано нами ранее.

Авторы:

Издание: Генетика
Год издания: 1998
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 1998.-N 6.-С.846-849
Просмотров: 46