КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ ПРЕДСКАЗАНИЯ СУБСТРАТНОЙ СПЕЦИФИЧНОСТИ ЦИТОХРОМОВ Р450

Аннотация:

Цитохромы Р450 являются важными ферментами участвующими в метаболизме множества лекарств. От состава и активности этих ферментов во многом зависит распределение лекарств в организме, их фармакологический и токсический эффект. Поэтому предсказание судьбы соединений в организме является насущной задачей для разработки новых лекарственных препаратов уже на самых ранних их этапах. Разные изоформы цитохромы Р450 могут окислять разнообразные химические соединения, причем их субстратная специфичность не коррелирует с таксономической классификацией данного суперсемейства. В работе рассмотрены основные методы предсказания субстратной специфичности цитохромов Р450 in silico. Эти методы разделены в зависимости от первичной информации, используемой в анализе: предсказание на основе аминокислотных последовательностей, структур субстратов (фармакофорные, QSAR модели, экспертные системы) и пространственной структуры белка-мишени (метод молекулярного докинга, оценка энергии взаимодействия). Обсуждаются как общие причины сложности прогноза субстратной специфичности цитохромов Р450 с использованием компьютерных методов, так и преимущества и ограничения описанных подходов.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2010
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2010.-N 1.-С.90-100. Библ. 51 назв.
Просмотров: 30