Полный текст
В работе представлены результаты генетического анализа ДНК М. tuberculosis, выделенных от больных туберкулёзом, находящихся в местах лишения свободы Кыргызской Республики, с последующим сравнением с глобальными базами данных генотипов М. tuberculosis. Метод сполиготипирования выявил генотип Beijing в 42 из 56 изолятов; другими выявленными сполиго-типами являлись ST262/Haarlem, ST254:/LAM и ST73, которые более специфичны для стран бывшего СССР и Европы. MIRU-VNTR-типирование по 12 локусам показало однородность изученной выборки (индекс Хантера - Гастона 0,66) и в то же время выявило микст-инфекцию в 8 (14,3%) образцах, 7 из которых содержало штамм Beijing. 28 (50%) штаммов принадлежало к варианту Beijing/M2 с профилем 223325153533, который характерен для России. Четыре штамма Beijing имели профили 12-MIRU, более характерные для Восточной Азии (Китай, Вьетнам). Дополнительная дифференциация 28 штаммов Beijing/M2 с использованием трёх гинервариабельных локусов VNTR позволила разделить их на 11 подтипов. Мутации устойчивости к рифампи-цину и изониазиду были выявлены в 28 и 55% штаммов соответственно; 13 из 15 генотипически мульти-резистентных штаммов относились к семейству Beijing. Таким образом, пенитенциарная популяция М. tuberculosis в Кыргызстане имеет значительное сходство с популяцией М. tuberculosis Северо-Западной Евразии, прежде всего России, и слабое генетическое родство с Восточной Азией. Методы инвертной 18бУ/0-ПЦР и VNTR-типирования с использованием гипервариабельных локусов являются эффективными для детекции и идентификации субтипов штаммов семейства Beijing непосредственно в ДНК М. tuberculosis, выделенной из мокроты.
Ж.Т. ИСАКОВА,И.В. М0КР0УС0В, В. ВЫЛЧЕВА, Н. А. СОВХОЗОВА, А. А. АЛДАШЕВ,Н.Т. РАСТОГИ
Добавить в коллекцию