ИЗУЧЕНИЕ ГЕТЕРОГЕННОСТИ ГЕНА 16S рРНК И groESL-OПЕРOHA В ОБРАЗЦАХ ДНК ANAPLASMA PHAGOCYTOPHILUM, EHRLICHIA MURIS И "CANDIDATUS NEOEHRLICHIA MIKURENSIS", ВЫЯВЛЕННЫХ В ТАЕЖНЫХ КЛЕЩАХ НА ТЕРРИТОРИИ УРАЛА, СИБИРИ И ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА

Аннотация:

Методом двухраундовой полимеразно-цепной реакции (ПЦР) исследованы на наличие ДНК эрлихий/анаплазм образцы от 3552 таежных клещей Ixodes persulcatus, собранных на территории Свердловской, Челябинской, Новосибирской, Иркутской областей и Хабаровского края. Во всех перечисленных областях в таежных клещах обнаружена ДНК Anaplasma phagocytophilum и Ehrlichia muris, при этом доля клещей, содержащих ДНК А. phagocytophilum, варьировала от 1,3 до 6,3%, а доля клещей, содержащих ДНК Е. muris, — от 2 до 14,1%. Кроме того, в 8 клещах, собранных на территории Новосибирской, Иркутской областей и Хабаровского края, была обнаружена ДНК "Candidatus Neoehrlichia mikurensis". Нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК и groESL-оперона (1240—1350 н.п.) были определены для 65 образцов ДНК A. phagocytophilum, 17 образцов ДНК Е. muris и 4 образцов ДНК "Candidatus Neoehrlichia mikurensis". Нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК и groESL -ontpona. Е. muris и "Candidatus Neoehrichia mikurensis" были высококонсервативными, при этом последовательности оперона как Е. muris, так и "Candidatus Neoehrlichia mikurensis" отличались от последовательностей, обнаруженных в других видах иксодовых клещей. На основе анализа последовательностей гена 16S рРНК i groESL-оперона все выявленные образцы ДНК A. phagocy tophilum могут быть отнесены к двум группам. У образцов из первой группы нуклеотидные последовательности groESL-опе- рона оказались идентичными друг другу, но существенно от личались от известных последовательностей groESL-ontpow (менее 98,2% сходства), а нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК соответствовали последовательности широко распространенного в мире и патогенного для людей варианта A. phagocytophilum (CAHU-HGE1, GenBank AF093788) или отличались от нее одной нуклеотидной заменой. В образцах и второй группы нуклеотидные последовательности groESL-oneрона различались между собой 1—4 нуклеотидными заменам] и были схожи (99,2—99,4% гомологии) с нуклеотидными по следовательностями groESX-onepoнa A. phagocytophilum, выявленными в Европе в образцах ДНК от Ixodes ricinus и косуль Нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК образцов и второй группы имели наибольшее сходство с последователь- ностью рибосомального гена редкого генетического варианта A. phagocytophilum, обнаруженного ранее на территории Китая (GenBank DQ342324).

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2011
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2011.-N 2.-С.17-23. Библ. 33 назв.
Просмотров: 112