Эволюционные изменения генов NA и НА вируса гриппа H3N2 в московском регионе в период 2003—2009 гг.

Аннотация:

Во время вспышки гриппа 2009 г. в Москве от больных людей выделяли вирусы гриппа H3N2 путем размножения в культурах кишечного (линия Сасо-2) или бронхиального (линия Calu-3) эпителия человека, поддерживающих расщепление вирусного белка HA0 -» НА1 + НА2 и многоцикловую репликацию вирусов. Анализ нуклеотидной последовательности вирусных РНК показал, что вирусы 2009 г. отличались от изолятов 2003 г. по 14 и 21 аминокислотам в белках нейраминидазы (NA) и гемагглютинина (НА) соответственно. Ген NA имел полноценную длину 1762 нуклеотида, тогда как изоляты 2003 г. имели делецию 66 нуклеотидов (22 аминокислоты) в стеблевом регионе ("короткий" генотип NA). NA изолятов 2009 и 2003 гг. имела аминокислотный профиль, характерный для штаммов, чувствительных к осельтамивиру и занамивиру. НА вирусов 2009 г. имел сайт гликозилирования Asn181 (Asn165 от сигнального пептида), что коррелировало с полноразмерной NA. Вирусы 2009 и 2003 гг. имели Phe209 и Ser209 соответственно в рецепторном центре НА, что коррелировало с их различиями в гемагглютинирующей активности. При филогенетическом сравнении гены NA московских вирусов 2003 и 2009 гг. находились в одном генетическом клэйде с единым общим предшественником, тогда как гены НА этих вирусов расходились на большую генетическую дистанцию и локализовались в различных клэйдах. Распределение вирусов на филогенетическом древе позволило предположить, что московские изоляты 2009 г. не были прямыми родственниками вируса 2003 г. и в период с 2003 по 2009 г. вирус гриппа H3N2 с "коротким" генотипом NA был вытеснен из московской популяции вирусом-мигрантом с полноразмерным геном NA.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2011
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2011.-N 5.-С.9-15. Библ. 29 назв.
Просмотров: 9