УТОЧНЕНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОГО ПОЛОЖЕНИЯ ПРОБИОТИЧЕСКИХ ШТАММОВ РОДА LACTOBACILLUS С ПОМОЩЬЮ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ГЕНОВ 16S rDNA и гроА

Аннотация:

Цель. Ревизия видовой идентификации коллекционных штаммов лактобацилл на основе секвенирования генов 16S rDNA и гроА. Материалы и методы. Исследованы 52 культуры лактобацилл, преимущественно представляющих коллекцию НИИЭМ им. Н.Ф.Гамалеи (GIMC). С помощью праймеров Lbl6a, Lbl6b, 16S-midford, 16S-midrev амплифицированы фрагменты гена 16S rDNA. Для анализа гена гроА применены два различных обратных праймера в зависимости от вида лактобацилл. Секвенирование фрагментов ДНК проведено на приборе 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems/Hitachi) с праймерами, использованными для амплификации. Результаты. Показана эффективность секвенирования двух мишеней в дифференциации видов внутри филогенетических групп лактобацилл. Продемонстрировано видовое разнообразие штаммов коллекции лактобацилл НИИЭМ им. Н.Ф.Гамалеи, включающее представителей 9 видов. Установлено, что все штаммы, маркированные ранее как L. acidophilus, относятся к L. helveticus. Обнаружены штаммы, относящиеся к недавно открытому виду L. farraginis, перспективному для использования в сельскохозяйственной практике. Заключение. Получены генетические паспорта оригинальных штаммов 9 видов лактобацилл, перспективных для дальнейшего исследования

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2012
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2012.-N 3.-С.18-24. Библ. 15 назв.
Просмотров: 62