COS-РАЙОН УМЕРЕННОГО БАКТЕРИОФАГА N15

Аннотация:

Определена последовательность нуклеотидов когезивных концов и близлежащих районов ДНК бактериофага N15. Когезивные 5'-концы являются выступающими комплементарными однонитевыми ДНК.Существенная гомология последовательностей N15 и ламбда обнаружена лишь в пределах около 50 н от левого и правого концов. У фага N 15 имеется район, нуклеотидная последовательность которого идентична участку R4 фага ламбда, предположительно взаимодействующему с терминазой. Этот район занимает то же положение по отношению к когезивной последовательности, как и у фага ламбда. Не обнаружено последовательностей. гомологичных участкам Rl, R2 и R3 ДНК ламбда. У фага N15 обнаружена последовательность, гомологичная последовательности IHF фага ламбда, ответственной за взаимодействие с фактором IHF, однако у N15 эта последовательность расположена вблизи правого, а не левого, как в ДНК ламбда, когезивного конца. С помощью компьютерного анализа найдены повторы и палиндромные последовательности в пределах 450 н, включающих когезивные концы. Подавляющее большинство бактериофагов имеют линейную двунитевую ДНК [5, 7]. Геномы большинства фагов (за исключением Т7), концы которых не защищены специальными белками, приобретают кольцевую форму после инъекции в цитоплазму. Эта циркуляризация происходит либо в результате рекомбинации между повторами на концах фаговой ДНК, либо путем комплементарного спаривания однонитевых последовательностей, называемых когезивными, расположенных на концах ДНК (12]. С другой стороны, в процессе репликации кольцевой фаговой ДНК образуются длинные конкатамеры, которые разрезаются по когезивным последовательностям и упаковываются в головку вириона. Разрезание конкатамеров происходит при участии специального фагового фермента - терминазы, которая вносит смещенные однонитевые разрывы в пределах когезивной последовательности, в результате чего формируются "зрелые" молекулы фаговой ДНК, имеющие свободные однонитевые когезивные концы. Структура когезивных концов изучена для многих бактериофагов, однако процесс формирования когезивных концов детально исследован только для фага ламбда и родственного ему фага 21 [6, 12,16-18]. Установлено, что терминаза вначале связывается с районом cosB, расположенным справа от cosпоследовательности. Образующийся комплекс ДНК - терминаза, комплекс 1, связывает предшественники головок вириона и формируется комплекс II. При участии комплекса II происходят разрезание ДНК по концам когезивной последовательности и упаковка. В пределах района cosB имеются три сходных участка Rl, R2 и R3, с которыми связывается терминаза [15]. Эти участки по отношению друг к другу являются прямыми и инвертированными повторами. Еще один участок, гомологичный этим - R4, расположен вне cosB, слева от когезивной последовательности. Кроме того, в пределах района cosB имеется участок II, с которым взаимодействует фактор интеграции хозяина (integration host factor, IHF) [9, 20]. Связывание IHF стабилизирует комплекс терминаза - ДНК, однако роль IHF для упаковки у фага ламбда является скорее вспомогательной, чем критической. Так, в клетках, лишенных IHF, урожай фага снижается в 3-4 раза и известны мутанты фага, лишенные зависимости от IHF [8, II, 15, 19]. Схема взаимного расположения упомянутых участков показана на рис. 1.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 1998
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 1998.-N 2.-С.17-20
Просмотров: 69