ХАРАКТЕРИСТИКА КОРОТКИХ ПОВТОРЯЮЩИХСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК СЕМЕЙСТВА MSAT-160 У ПОЛЕВКИ Microtus arvalis (Rodentia, Cricetidae)

Аннотация:

Из HindIII-гидролизата геномной ДНК полевки Microtus arvalis клонированы короткие нуклеотидные последовательности длиной около 160 п.н., о они гомологичны (в среднем на 78%) семейству тандемно организованных повторов MSAT-160 полевки М. chrotorrhinus. Попарное сравнение нуклеотидных последовательностей MSAT-160 М. arvalis позволило заключить, что различия между мономерами имеют неслучайный характер. На основании сходства в распределении замен исследованные мономеры удалось разделить на три класса. В пределах первого класса выявлены две группы полностью идентичных последовательностей. При контекстном анализе обнаружено, что фрагмент последовательности пяти идентичных мономеров, составляющих первую группу, может быть представлен в виде вторичной структуры, сходной с автокаталитическим доменом РНК-содержащих вирусов. В статье обсуждаются вопросы о происхождении и возможных функциях повторов данного семейства.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1998
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 1998.-N 4.-С.603-608
Просмотров: 15