ВЫСОКОРАЗРЕШАЮЩЕЕ ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ ГЕНОТИПА BEIJING РОССИЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Аннотация:

Генотип Beijing Mycobacterium tuberculosis эндемичен для России и широко распространён в мире. Штаммы Beijing привлекают внимание с клинической точки зрения, поскольку демонстрируют важные патогенные свойства. Провели анализ репрезентативной выборки российских штаммов М. tuberculosis генотипа Beijing с использованием методов IS6770-RFLP и 27 локусов VNTR. Предложили минимальную схему VNTR-типирования на основе 7 локусов - QUB-llb, Mtub21, QUB-26, MIRU26, QUB-3232, VNTR-3820, VNTR-4120 - для скринингового анализа штаммов М. tuberculosis генотипа Beijing в России. В то же время сочетанное применение методов VNTR и IS6770-RFLP необходимо для высокоразрешающего типирования этих штаммов. В результате анализа генетически гетерогенной коллекции штаммов показано, что группа близкородственных штаммов Beijing (кластер ВО/ W148) представляет «успешный» клон М. tuberculosis, широко и недавно распространившийся в России. Ключевые слова: М. tuberculosis, генотипирование, VNTR, генотип Beijing. Эволюция генома возбудителя туберкулёза Mycobacterium tuberculosis характеризуется отсутствием горизонтального генетического переноса, что приводит к формированию клональной по-пуляционной структуры вида, включающего различные генетические семейства. Генотип Beijing (другое название пекинский генотип) является наиболее изученным вариантом М. tuberculosis, отмеченным многочисленными волнами распространения за пределы региона его возникновения - Северного Китая [4, 17]. Штаммы Beijing привлекают внимание с клинической точки зрения, поскольку демонстрируют важные патогенные свойства , которые, однако, могут варьировать у различных штаммовых вариантов внутри генотипа . Цель исследования - оценка дискриминирующей способности новых локусов VNTR и их комбинаций для выбора оптимальной схемы скринингового и исчерпывающего (детального) типирования штаммов Beijing, циркулирующих на Северо-Западе России.

Авторы:

Издание: Туберкулез и болезни легких
Год издания: 2012
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2012.-N 7.-С.46-53. Библ. 26 назв.
Просмотров: 86