ВЫСОКАЯ ГОМОЛОГИЯ ПЛАЗМИД, НЕСУЩИХ ГЕНЫ СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ II КЛАССА - ИЗОШИЗОМЕРОВ ECORV, И ИХ РАСПРОСТРАНЕНИЕ В ПРИРОДНЫХ ШТАММАХ ESCHERICHIA COLI

Аннотация:

При скрининге 660 штаммов семейства Enterobacteriaccae. выделенных в различных регионах Украины, на наличие специфической эндонуклеазной активности в 6 штаммах Escherichia coli нами были обнаружены рестриктазы - изошизомеры EcoRV. Гены, кодирующие соответствующие эндонуклеазы и метилтрансферазы. расположены на небольших мультикопийных Hsd^-плазмидах идентичного размера (6.2 т. п. н.). Все плазмиды успешно перенесены в лабораторный штамм Escherichia coli К802. Для всех этих плазмид построены физические карты, которые совпадают с картой ранее обнаруженной плазмиды pLBI [3, 10). несущей гены системы рестрикции-модификации EcoRV. Сравнение электрофоретичсских профилей фрагментов ДНК плазмид, полученных при гидролизе различными мелкошепящими сайт-специфичсскими энлонуклеазами, показало высокую гомологию этих плазмил и плазмиды pLBI. Это, по-видимому, связано c возможностью эффективного горизонтального переноса плазмид п природных условиях. Сайт-специфические эндонуклеазы и соответствующие им ДНК-метилтрансферазы II класса широко распространены среди микроорганизмов 121 1. Гены этих ферментов могут быть локализованы как на плазмидах, например EcoRI [91, EcoRII 1161, Styl [181, PaeR7 [13] и Eco29kl (191, так и на хромосоме - Dpnl, Dpnll [171 и Sail [11], и пока не имеется никаких данных, указывающих на то, что одно местоположение было бы предпочтительно другому. Система рестрикции - модификации EcoRV была впервые идентифицирована в полиплазмидном штамме Е. coli 74, выделенном от больного в Москве [1, 141. Ранее было описано, что гены EcoRVR и EcoRVM расположены на небольшой (6,2 т. п. н.) мобилизуемой Hsd -плазмиде с ColEI-подобным репликоном, обозначенной pLBI 110] или pLG13 (З]. Эти гены были клонированы и для них была определена первичная нуклеотидная последовательность 15, 10]. До настоящего времени найдено всего несколько штаммов, представленных различными родами бактерий, синтезирующих изошизомеры EcoRV [12, 211, но упоминания о плазмидной локализации соответствующих генов эндонуклеаз рестрикции и ДНК-метилтрансфераз ни в одном из них не было. Эти данные вызывают определенный интерес, если учесть, что плазмидная локализация EcoRV-генов должна способствовать их широкому распространению среди бактерий, пермиссивных для плазмид ColEI-типом репликации, и что EcoRV-тип метилирования не узнается известными бактериальными системами рестрикции метилированной ДНК [20]. Целью данной работы явились поиск изошизомеров EcoRV в штаммах семейства Enterobacteriaceae и их сравнение с прототипом.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 1998
Объем: 3с.
Дополнительная информация: 1998.-N 3.-С.20-22
Просмотров: 60