СПЕЦИФИЧНЫЕ МОТИВЫ В ГЕНОМАХ СЕМЕЙСТВА CHLAMYDIAСЕАЕ

Аннотация:

Поиск генетических областей, которые могут служить надежными и удобными маркерами при идентификации и типировании бактерий, остается актуальной задачей современной молекулярной биологии. Прогресс в секвенировании привел к стремительному росту базы данных полногеномных нуклеотидных последовательностей бактерий, поэтому появилась возможность поиска и выбора генетических мишеней для систем идентификации или генотипирования среди полного набора бактериальных генов на основе прямого сравнительного анализа полногеномных последовательностей. В настоящей работе проведен сравнительный анализ геномов представителей разных видов семейства Chlamydiaceae с целью выявления специфичных нуклеотидных мотивов, способных служить генетическими маркерами этого семейства. Поиск консенсусных участков выполняли с помощью макросов, написанных на языке Visual Basic for Application в среде MS Excel. Критерием выбора консенсусных последовательностей являлось полное совпадение в сравниваемых геномах участков протяженностью oт 25 нуклеотидов. В исследование было взято по одной полногеномной последовательности от каждого представителя 8 видов Chlamydiaceae.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2012
Объем: 3с.
Дополнительная информация: 2012.-N 3.-С.26-28. Библ. 9 назв.
Просмотров: 35