ИДЕНТИФИКАЦИЯ ВНУТРИКЛЕТОЧНЫХ МЕТАБОЛИТОВ Spiroplasma melliferum МЕТОДОМ ВЭЖХ-МС

Аннотация:

В противовес изобилию системно-ориентированных подходов, описывающих изменения в транскриптоме или протеоме, опубликовано относительно немного исследований, посвященных метаболитам. Целью нашей работы была максимально возможная идентификация внутриклеточных метаболитов Spiroplasma melliferum с помощью метода хроматографии, совмещенной с высокоточной масс-спектрометрией. Объектом исследований являлись бактерии класса Молликут S. melliferum из-за предельной простоты их метаболизма. Идентификацию подтверждали фрагментированием предварительно детектированных ионов методом тандемной масс-спектрометрии. Особенность применяемого метода анализа состоит в том, что используется гидрофильная хроматография — метод разделения полярных веществ с использованием полярной сепарирующей фазы при переходе элюентов от неполярного к полярному. Для разделения метаболитов мы использовали два вида аналитических колонок (неподвижная фаза силикагель и аминопропилированный силика-гель) с последующей регистрацией ионов в положительном и отрицательном режимах съемки для каждой колонки. Нам удалость надежно детектировать 76 метаболитов, включая важнейшие классы внутриклеточных веществ, участвующих в основных метаболических процессах бактерии. Мы идентифицировали около трети веществ из списка всех возможных метаболитов S. melliferum, составленного на основе аннотации генома этих бактерий.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2012
Объем: 15с.
Дополнительная информация: 2012.-N 8.-С.1052-1066. Библ. 32 назв.
Просмотров: 36