ШТАММОВАЯ КЛАССИФИКАЦИЯ STAPHYLOCOCCUS AUREUS ПОСРЕДСТВОМ ПРЯМОГО МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОГО ПРОФИЛИРОВАНИЯ

Аннотация:

Staphylococcus aureus - один из наиболее интересных для клинических исследований видов микроорганизмов, обладающий большим штаммовым разнообразием, в первую очередь за счёт вариабельности факторов вирулентности и патогенности. Целью настоящего исследования явилась апробация метода быстрой штаммовой дифференциации стафилококков по определённому признаку на основании регистрации отличительных особенностей MALDI масс-спектров, накапливаемых в ходе прямого белкового профилирования бактериальной клетки. В качестве модельных признаков, регистрируемых как штаммовые отличия, были выбраны продукция бета-лактамазы и альфа-гемолизина, обусловленные наличием генов blaZ и hlа соответственно. Математический анализ совокупности MALDI масс-спектров, накопленных доя 53 изолятов S. aureus с применением генетического алгоритма кластеризации, позволил построить две независимые классификационные модели, способные дифференцировать штаммы по рассматриваемым признакам. По статистическому вкладу в модель каждого масс-пика были выявлены наиболее значимые пики (массы), которые можно рассматривать как маркеры штаммовых различий стафилококков. Построенные диагностические модели отличались коэффициентами чувствительности и специфичности, которые составили 97,5% и 82,5% для разделения штаммов по признаку продукции бета-лактамазы и 90,0% и 88,7% по наличию альфа-гемолизина.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2012
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2012.-N 5.-С.501-513. Библ. 25 назв.
Просмотров: 75