КИНЕТИЧЕСКИЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ АР-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 ИЗ Saccharomyces cerevisiae С ДНК-СУБСТРАТАМИ

Аннотация:

Апуриновая/апиримидиновая эндонуклеаза из дрожжей Saccharomyces cerevisiae Apn1 — один из ключевых ферментов, участвующих в эксцизионной репарации оснований (ЭРО). Основная функция данного фермента заключается в расщеплении фосфодиэфирной связи с 5'-стороны от апуринового/апиримидинового сайта (АР-сайта) в двуцепочечной ДНК, приводя к образованию одноцепочечного разрыва с З'-гидроксильным и 5'-дезоксирибозофосфатным концами. В настоящей работе исследовали конформационную динамику ДНК-субстратов в ходе взаимодействия с Apn1 и кинетический механизм данного процесса. Для этого использовали метод «остановленной струи» с регистрацией интенсивности флуоресценции остатков 2-аминопурина и пирролоцитозина, содержащихся по соседству или напротив повреждения. Обнаружено, что обе цепи ДНК претерпевают ряд быстрых изменений при взаимодействии с Apn1, а положение флуоресцентных аналогов оснований в цепи ДНК не влияет на каталитическую стадию реакции, катализируемой Apn1. Сравнение полученных данных для Apnl с имеющимися в литературе для человеческой Ape1 обнаружило различия в их взаимодействии с ДНК-субстратами.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2012
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2012.-N 10.-С.1401-1412. Библ. 29 назв.
Просмотров: 51