ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ РОТАВИРУСОВ ГРУППЫ А, ВЫЯВЛЕННЫХ В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ В 2007—2011 ГГ.

Аннотация:

Проведен генетический анализ изолятов ротавируса группы А, выявленных в фекалиях детей, госпитализированных в стационары Новосибирска и Омска в течение 4 эпидемических сезонов: 2007, 2007/08, 2009/10, 2010/11. Методом мультиплексной ПЦР генотипировано 1416 изолятов ротавируса группы А. Показано, что в 2007—2011 гг. в Западной Сибири социркулиро-вали изоляты широко распространенных генотипов G1P , G4P, G2P, G3P.В единичных случаях определены генотипы G9P , G2P , G3P и G4P , В 2008 г. в Омске, а в 2009 г. в Новосибирске произошла замена доминирующего генотипа G1P генотипом G4P , Встречаемость и спектр циркулировавших генотипов различались и изменялись каждый эпидемический сезон в обоих городах. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей 3 фрагментов генома, кодирующих белки VP4 (VP8*), VP7 и VP6, показал, что большинство новосибирских и омских изолятов кластеризовались вместе и демонстрировали высокую степень гомологии с изо-лятами, выявленными в других регионах Евразии. Кроме того, впервые в Новосибирске обнаружены 14 изолятов ротавируса (генотипов G9, G1 и G4), относящихся к редкой сублинии Р[8]Ь (OP354-like) гена, кодирующего белок VP4, а в Омске — единственный изолят Omsk08-381/G9P[8 |b. Результаты, полученные в этом исследовании, указывают на необходимость длительного мониторинга изолятов ротавируса, циркулирующих на территории Западной Сибири, ч то важно при выборе ротавирусной вакцины для иммунизации детей раннего возраста, совершенствования диагностических наборов для этой инфекции, а также для понимания эпидемиологии и эволюции ротавирусов группы А. Ключевые слова: ротавирусы группы A, VP4, VP6, УР7, дети, генотипирование, фичогенетический анализ

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2012
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2012.-N 4.-С.33-41. Библ. 18 назв.
Просмотров: 32