Система анализа и пространственной визуализации данных по лекарственной устойчивости и молекулярному типированию возбудителей ИППП

Аннотация:

Одной из важных проблем борьбы с инфекциями, передаваемыми половым путем (ИППП), является распространение лекарственной устойчивости возбудителей. В рамках российской программы по мониторингу антибиотикорезистентности N. gonorrhoeae (RU-GASP) и программы «Система анализа данных и прогнозирования распространения антибиотикорезистентности штаммов Т. pallidum на территории Российской Федерации на основе методов молекулярной эпидемиологии», разработанной ГНЦДК1, производятся сбор изолятов возбудителей, их молекулярное типирование и анализ лекарственной устойчивости. Эти исследования направлены на разработку технологии оценки и прогноза распространенности антибиотикорезистентных штаммов возбудителей инфекций, передаваемых половым путем (ИППП), выявление факторов, определяющих динамику лекарственной устойчивости возбудителей, и оценку связи между мутациями возбудителя и лекарственной устойчивостью. При решении этих задач применяются современные методы статистического анализа пространственно распределенных величин и ГИС-технологии2. Эти методы реализованы в разработанной нами программе STIanafor (STI Analysis & Forecasting), позволяющей сопоставлять данные по лекарственной устойчивости возбудителей с информацией о заболеваемости, данными молекулярного типирования и результатами филогенетического анализа геномов возбудителей. Программа позволяет строить карты географического распределения заболеваемости, лекарственной устойчивости, рассчитывать индексы резистентности, анализировать распространенность мутантных возбудителей по регионам, представлять возможные варианты миграционного переноса возбудителя. Она также позволяет прогнозировать развитие лекарственной резистентности и заболеваемости по данным и экспертным оценкам.

Авторы:

Издание: Врач и информационные технологии
Год издания: 2012
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2012.-N 6.-С.26-35. Библ. 5 назв.
Просмотров: 31