СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ВИРУСНЫХ РНК-ЗАВИСИМЫХ РНК-ПОЛИМЕРАЗ. Обзор

Аннотация:

В настоящем обзоре рассматриваются современные данные о структуре вирусных РНК-зависимых РНК -полимераз (RdRP), полученные в результате рентгеноструктурного анализа, и обсуждается функциональное значение элементов структурной организации этих ферментов. Поскольку большая часть исследований к настоящему времени выполнена для RdRP пикорна-, флави- и калицивирусов, в настоящем обзоре рассматриваются структуры RdRP преимущественно этих групп вирусов, с привлечением сведений о полиме-разах других вирусных семейств. РНК-зависимые РНК-полимеразы — класс ферментов, изначально известных как вирус-специфические, но впоследствии обнаруженных и в незараженных эукариотических клетках, в которых такие ферменты осуществляют синтез малых ядерных РНК, участвующих в РНК-сайленсинге . Вирус-специфическая RdRP в комплексе с другими вирусными и клеточными белками обеспечивает полный цикл репликации в цитоплазме зараженной клетки, приводящий к образованию дочерних молекул геномной «+» РНК. Большинство RdRP осуществляют синтез РНК при участии праймера, в роли которого может выступать олигонулеотид или белок, ковалентно присоединенный к геномной РНК, но для некоторых полимераз показана возможность катализировать синтез de novo . Исследования RdRP изначально проводились на базе того, что было известно о структурах ранее закристаллизованных полимераз — ДНК-полимеразы Е. coli (фрагмент Кленова), Тaq-ДНК-полимеразы, Т7 ДНК- и РНК-поли-мераз и ревертазы ВИЧ, поскольку данные анализа последовательностей и предсказания вторичных структур этих полимераз говорили об их сходстве. Поэтому задолго до того, как был получен первый кристалл RdRP , было проведено множество мутационных исследований и выявлены функционально важные участки этих ферментов. Таким образом, общая для всех полимераз структура активного центра, в котором происходит формирование фосфодиэфирной связи, была предсказана в экспериментах с мутациями этого участка, а уже затем подтверждена получением соответствующих комплексов в кристаллах. В настоящее время расшифрованы структуры RdRP представителей семейств вирусов, геном которых представлен как одноцепочечной, так и двуцепочечной РНК: пикорнавирусов (по-лиовируса , риновирусов человека , вируса ящура , вируса коксаки , калицивирусов (вируса геморрагической лихорадки кролика (RHDV) , норовирусов , са-повирусов , бирнавирусов (вируса инфекционной болезни птиц (1BDV), вируса панкреатического некроза рыб ), флавивирусов (вируса Западного Нила, вируса гепатита С (HCV) ), цистовирусов , рео-вирусов и бактериофага QP . Были также получены кристаллы комплексов RdRP с NTP, олиго- и полинуклеотидами, ионами ме-; таллов и различными ингибиторами. RdRP имеет пространственную структуру, характерную для полимераз /

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2013
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2013.-N 3.-С.314-319. Библ. 61 назв.
Просмотров: 138