ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ YERSINIA PESTIS, ИЗОЛИРОВАННЫХ ИЗ ВОСТОЧНО-КАВКАЗСКОГО ВЫСОКОГОРНОГО ПРИРОДНОГО ОЧАГА ЧУМЫ В 2010 ГОДУ

Аннотация:

Возбудитель чумы Yersinia (Y.) pestis явился причиной гибели сотен миллионов людей во время трех пандемий этой инфекции. Вид У. pestis относительно недавно произошел от У. pseudotuberculosis серотипа 0:1Ь, приобретя, путем горизонтального переноса, 32 хромосомных гена и две дополнительные плазмиды, что обусловило повышение вирулентных свойств. Для определения подвидов и биоваров Y. pestis используются такие свойства, как способность ферментировать различные субстраты, вирулентность для животных, питательные потребности, строение генома и другие. В последние годы все большее внимание обращено на изучение геномного полиморфизма чумного микроба методами, обладающими высокой дискриминирующей способностью, такими как мультилокусный анализ вариабельного числа тандемных повторов (MLVA), анализ отличающихся участков ДНК (DFR) и анализ коротких палиндромных повторов, разделенных спейсерами (CRISPR). Данные методы позволяют проводить внутривидовое дифференцирование штаммов pestis и могут быть использованы для решения молекулярно-эпидемиологических задач различного генеза. По результатам типирования методами DFR, MLVA и CRISPR создан постоянно пополняемый электронный каталог, насчитывающий уже более восьмиста штаммов У. pestis. Метод DFR основан на определении присутствующего в геноме У. pestis набора из 23 DFR-локусов участков генома, по которым различаются штаммы в пределах одного вида. Локус с вариабельным числом тандемных повторов (VNTR) включает в себя центральный вариабельный участок и фланкирующий консервативный, ограничивающий его с двух сторон. Вариабельный участок состоит из нескольких повторов ДНК. Число повторов может варьировать, изменяя длину нуклеотидной последовательности.

Авторы:

Издание: Медицинский вестник Северного Кавказа
Год издания: 2013
Объем: 2с.
Дополнительная информация: 2013.-N 1.-С.98-99. Библ. 5 назв.
Просмотров: 54