ЭФФЕКТ СУПРЕССИИ Р-ЭЛЕМЕНТОВ С МАРКЕРНЫМ ГЕНОМ MINI-WHITE В МЕЖГЕННЫХ РАЙОНАХ DROSOPHILA MELANOGASTER

Аннотация:

Рассмотрено распределение Р-элементов с маркерным геном mini-white (цвет глаз) в различных по типу межгенных районах в геноме Drosophila melanogaster. Классификация межгенных районов проведена по количеству промоторов в нем на основе взаимной ориентации фланкирующих межгенный район генов. Выяснилось, что наибольшее количество транспозонов расположено в межгенных районах с общей промоторной областью фланкирующих генов, при этом наибольшая супрессия маркерного гена транспозонов наблюдается в районах, фланкированных генами с общей З'-областью. Показана связь различных классов межгенных районов с различным состоянием хроматина. Области, свободные от генов, кодирующих белок, занимают порядка половины размера генома эукариот. При этом межгенные районы содержат различные элементы, начиная от транскрипционно «тихих» тандемно повторяющихся сателлитных последовательностей и заканчивая транскрипционно активной некодирующей РНК. В геноме человека с помощью ассоциативного анализа найдено множество точковых полиморфизмов, связанных с проявлением болезни или других фенотипических признаков, около половины которых лежит в межгенных областях. Таким образом, учитывая размер данной категории генома и его проявление в манифестации фенотипа, крайне актуален вопрос о его функциональной значимости. Особенности приоритета встраивания транспозонов в геномный контекст Drosophila melanogaster исследуются на протяжении многих лет. Попытки найти локальный нуклеотидный контекст не идентифицировали однозначного консенсуса встроек. Вместе с тем анализ карты локализации транспозонов отчетливо показал корреляцию сайтов встроек с промоторными районами, при этом степень корреляции зависит от линии Р-элементов.

Авторы:

Издание: Цитология
Год издания: 2013
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2013.-N 3.-С.181-184. Библ. 10 назв.
Просмотров: 24