Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

Молекулярные технологии детекции возбудителя сибирской язвы посредством ПЦР различных форматов


Аннотация:

Точная идентификация бактерий Bacillus anthracis остается сложной задачей при идентификации возбудителя сибирской язвы на фоне близкородственных видов В. cereus и В. thuringiensis ввиду высокой степени подобия нуклеотидных последовательностей представителей группы Bacillus cereus sensu lato (Bacillus cereus s.l.), к которой принадлежат указанные микроорганизмы. В данном исследовании разработаны наборы праймеров и зонды для ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией для отличия бацилл В. anthracis от В. cereus и В. thuringiensis, а также наборы праймеров для стандартной ПЦР с электрофоретической детекцией. Для представителей группы Bacillus cereus s.l. проанализированы нуклеотидные последовательности генов rpoB,plcr и ssp, содержащихся в хромосомной ДНК, которые могут являться молекулярно-генетическими маркерами для их типирования. Мишенью для праймеров и зондов определен фрагмент гена ssp хромосомной ДНК, характеризующийся гексануклеотидной вставкой только у штаммов В. anthracis. Стандартная ПЦР с электрофоретической детекцией и разработанным набором праймеров позволяет надежно отличать бациллы В. anthracis от близкородственных видов В. cereus и В. thuringiensis. Использование ПЦР-РВ с зондами в форматах TaqMan и молекулярного маяка также дает возможность проводить точную идентификацию бацилл В. anthracis: сигнал флуоресценции для шпилечных проб в формате молекулярного маяка был положительным только для штаммов В. anthracis, а для других представителей группы Bacillus cereus s.l. — отрицательным. При использовании линейных проб TaqMan регистрировали высокоинтенсивный сигнал флуоресценции для всех изолятов В. anthracis и сигнал значительно более низкой интенсивности для других представителей группы Bacillus cereus s.l. Разработанные подходы могут быть полезными для клинических, эпидемиологических и эпизоотологических исследований.

Авторы:

Лиманская О.Ю.
Муртазаева Л.А.
Klee S.
Лиманский А.П.

Издание: Биотехнология
Год издания: 2013
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2013.-N 3.-С.86-95. Библ. 35 назв.
Просмотров: 85

Рубрики
Ключевые слова
anthracis
bacillus
cereus
sen
thuringiensis
бактерии
бациллы
биотехнология
близкородственные
болеющие
бытовые
видовая
возбудители
возможности
временная
вставочный
высокий
высокоинтенсивные
гексаны
гена
генов
гибридизация
групп
данных
детекция
днк
другого
задач
зонд
зондовое
идентификации
изоляты
интенсивность
использование
исследование
клиническая
ключ
линейная
маркер
маяк
микроорганизмов
микроорганизмы
мишени
молекулярная
набор
наборы
низкие
нуклеотидный
определения
отличия
отрицательное
подход
поза
полезная
полимеразная
положительные
последовательностей
праймер
представители
пцр
различный
реакция
регистр
сибирская
сибирь
сигнал
слова
сложные
содержащая
стандартизация
стандартная
стандартные
степени
технология
типирование
точная
указ
флуоресценция
фоновое
фрагмент
характер
хромосомный
цепная
штамм
электрофоретический
эпидемиологическая
эпизоотологические
язва
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 18.97.14.80)
Яндекс.Метрика