МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ CORYNE-BACTERIUM DIPHTHERIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ В РОССИИ В 2002-2012 ГГ.

Аннотация:

Характеристика современных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России, с помощью мультилокусного секвенирования ДНК (М LST). Изучено 28 токсигенных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России в 2002 — 2012 гг. и присланных в референс-центр по дифтерии и коклюшу МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского. Генотипирование штаммов С. diphtheriae с помощью MLST проводили на основе секвенирования фрагментов генов atpA, dnaE, dnaK, fusA, leuA, odhA и rpoB. Идентификацию аллелей и ST осуществляли согласно EMBL/GenBank и PubMLST, для кластерного анализа использовали eBurst подход. С помощью MLST охарактеризованы современные токсигенные штаммы C.diphtheriae, выделенные в России в 2002 — 2012 гг. Идентифицировано 8 генотипов (ST41, ST5, ST8, ST28, ST25, ST44, ST-newl и ST-new2), доминирующими среди которых были три — ST8, ST28 и ST-newl. Большинство токсигенных штаммов принадлежат к биовару gravis и ST8. Среди штаммов биовара mitis отмечается большая гетерогенность по принадлежности к ST, но с преимущественным преобладанием штаммов ST28. Использование MLST позволило охарактеризовать современную циркулирующую популяцию токсигенных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России, и показало перспективность применения этого метода для характеристики популяции возбудителя дифтерии и выявления эпидемически значимых штаммов, а также сопоставления их с генетической структурой зарубежных штаммов.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2013
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2013.-N 4.-С.17-23. Библ. 16 назв.
Просмотров: 56