Вирус Хурдун (KHURV): новый вирус рода Orthobunyavirus (Bunyaviridae)

Аннотация:

Вирус Хурдун (Khurdun virus, KHURV) был изолирован в 2001 г. от лысухи (Fulicaatra Linnaeus, 1758) в дельте Волги (Астраханская область, Россия). Вирус не удалось идентифицировать иммунологическими методами. В настоящей работе геном вируса KHURV был секвенирован de novo (на приборе MiSeq, lllumina). Показано, что геном KHURV представлен тремя сегментами РНК негативной полярности (L-сегмент, 6256 и.о.; М-сегмент, 3161 и.о.; S-сегмент, 950 и.о.). Концевые последовательности геномной РНК представлены каноническими для вирусов рода Orthobunyavirus (Bunyaviridae) повторами. Уровень идентичности белков KHURV с ортобуньявирусами составляет от 22% (N) до 30% (RdRp). S-сегмент KHURV не кодирует белок NSs. Характерной особенностью KHURV является укороченный М-сегмент, который в отличие от ортобуньявирусов не кодирует белок NSm. Также меньшим размером отличается поверхностный белок Gn (679 а.к. против 950 а.к.). Вместе с тем уровень идентичности оболочечных белков Gn и Gc вируса KHURV с ортобуньявирусами составляет 28 и 30% соответственно. На основе молекулярно-генетического и филогенетического анализа вирус KHURV был предварительно отнесен нами к роду Orthobunyavirus (Bunyaviridae). Вместе с тем, учитывая уникальную структуру М-сегмента, нельзя исключать возможность выделения KHURV в отдельный род "Khurduvirus" в составе сем. Bunyaviridae.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2013
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2013.-N 4.-С.10-13. Библ. 12 назв.
Просмотров: 65