Молекулярно-генетическая характеристика вирусов Бханджа (BHAV) и Раздан (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированных от иксодовых клещей Rhipicephalus bursa Canestrini & Fanzago, 1878, и Dermacentor marginatus Sulzer, 1776, в Закавказье

Аннотация:

Проведено полногеномное секвенирование de novo (на приборе MiSeq, lllumina) вирусов Бханджа (BHAV; штамм LEIV-Az1818), изолированного из иксодовых клещей Rhipicephalus bursa Canestrini & Fanzago, 1878, в Азербайджане (1973 г.) и Раздан (RAZV; штамм LEIV-Arm2741), выделенного от клещей Dermacentor marginatus Sulzer, 1776, в Армении (1972 г.). Уровень идентичности между аминокислотным последовательностями белков двух вирусов составил 95,8% (RdRp, L-сегмент), 90,3% (GnGc, М-сегмент), 92,5% (N, S-сегмент), 87,9% (NSs, S-сегмент) соответственно, на основании чего RAZV был отнесен нами к группе BHAV. Уровень идентичности RAZV по белку G составляет более 90% с европейскими изолятами BHAV и 85% с африканским вирусом Форекария (FORV). Вирус BHAV LEIV-Az1818 наиболее близок (99%) к индийскому штамму BHAV IG690. С европейскими изолятами BHAV LEIV-Az1818 обладает 90% идентичности. Геном вирусов BHAV имеет структуру, характерную для флебовирусов, передающихся клещами. В результате проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа определено таксономическое положенное RAZV и показано, что вирусы группы BHAV формируют обособленную группу в составе рода Phlebovirus (Bunyaviridae). Ключевые слова: буньявирусы, флебовирусы, вирус Бханджа, ВНАV, вирус Раздан, RAZV, арбовирусы, полно-геномное секвенирование.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2013
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2013.-N 4.-С.14-19. Библ. 24 назв.
Просмотров: 56