РЕТРОТРАНСПОЗОН КЛАССА LINE ЯВЛЯЕТСЯ КОМПОНЕНТОМ ПАТТЕРНА ПОЛИМОРФНЫХ ФРАГМЕНТОВ ПАРТЕНИТ ТРЕМАТОДЫ HIMASTHLA ELONGATA

Аннотация:

Мы определили, что метод S-SAP (sequence specific amplification polymorphism) выявляет клональную изменчивость партеногенетических личинок червя Himasthla elongata (Trematoda, Echinostomatidae), ранее считавшихся генетически однородными. Провели клонирование и секвенирование консервативного продукта длиной -500 п. н. Клонированный фрагмент обозначили как В1 по зоне агарозного электрофореза, из которого он клонирован. Анализ последовательности В1 показал, что фрагмент имеет максимальное сходство с элементами класса LINE CR1-семейства воробья и гидры. Гибридизация in situ (FISH) выявляет диспергированное распределение В1. Остальные фрагменты, клонированные из той же зоны, соответствуют, как и В1, консервативной области обратной транскриптазы (RT) элементов семейства CR1. Таким образом, показано: 1) церкарии трематоды Н. elongata обладают клональной изменчивостью; 2) метод S-SAP позволяет получить паттерн распределения фрагментов, характеризующий отдельных церкарий; 3) консервативный район RT вносит свой вклад в образование паттерна полиморфных фрагментов при выявлении клональной изменчивости партенит Н. elongata методом S-SAP. В дальнейшей работе предполагается определить наличие транскриптов CR1 в церкариях Н. elongata и определить состав вариабельных фрагментов паттерна клональной изменчивости.

Авторы:

Издание: Цитология
Год издания: 2013
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2013.-N 7.-С.492-500. Библ. 42 назв.
Просмотров: 37