Таксономия вируса Хасан (Khasan, KHAV) - нового вируса рода Phlebovirus (сем. Bunyaviridiae), изолированного из клещей Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) в Приморском крае (Россия)

Аннотация:

Вирус Хасан (Khasan virus - KHAV) был изолирован в Хасанском районе Приморского края в 1971 г. из клещей Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901), собранных с пятнистых оленей Cervus nippon Temmink, 1838. На основании биологических свойств и морфологии вириона KHAV был отнесен к неклассифицированным вирусам сем. Bunyaviridae. В настоящей работе для уточнения таксономического положения KHAV геном вируса был частично секвенирован с использованием технологии секвенирования следующего поколения (next-generation sequencing). На основании филогенетического анализа частичных последовательностей всех трех сегментов генома KHAV был отнесен нами к роду Phlebovirus. Филогенетически KHAV наиболее близко группируется с вирусами группы UUKV и обладает с ними на анализируемых участках генома до 62% идентичности. Максимальный уровень идентичности наблюдается для фрагментов последовательности РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp). Уровень гомологии KHAV с клещевыми вирусами группы UUKV составляет от 50 до 62%, тогда как с москитными флебовирусами это значение не превышает 30%.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2013
Объем: 4с.
Дополнительная информация: 2013.-N 5.-С.15-18. Библ. 18 назв.
Просмотров: 65