О ПОСТРОЕНИИ МЕДИЦИНСКИХ ТЕСТ-СИСТЕМ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЖАДНОГО АЛГОРИТМА И МЕТОДА ОПОРНЫХ ВЕКТОРОВ

Аннотация:

В работе приводится формализованная постановка задачи об отборе параметров и построении классификатора для геномной медицинской тест-системы математическими методами машинного обучения без использования специальных биологических и медицинских знаний. Предлагается метод решения данной задачи и обсуждаются результаты апробации этого метода на мирочиповом наборе данных, содержащем информацию о полногеномном транскриптоме образцов эстрогенположительных опухолей молочной железы. Апробация показала, что качество классификации, обеспечиваемое построенной тест-системой и осуществляемой на основе оценок экспрессии 12 генов, не уступает качеству классификации, осуществляемой такими тест-системами, как "OncotypeDX" и "MammaPrint". Медицинские тест-системы позволяют на основе обработки результатов измерений получать информацию, связанную с диагностикой разных заболеваний, выработкой рекомендаций по выбору терапии, прогнозированием течения заболевания и успешностью схемы лечения. В последние годы активно изучаются и внедряются в клиническую практику исследования и тест-системы, в которых результаты измерений, лежащие в основе формируемых выводов и рекомендаций, связаны с молекулярно-генетическими особенностями пациентов. В частности, индивидуальное генотипирование (получение информации об индивидуальных особенностях генома) используется в клинической практике и в диагностических и прогностических целях. Ярким примером здесь является изучение вариантов (мутаций) генов BRCA1 и BRCA2: информация о наличии мутаций этих генов может служить основной для принятия решения об упреждающей терапии, вплоть до профилактической мастэктомии или профилактической простатэктомии.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2013
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2013.-N 11.-С.654-658. Библ. 15 назв.
Просмотров: 45