Таксономия вируса Баку (ВАКУ - Baku virus; Reoviridae, Orbivi-rus), изолированного из облигатных паразитов птиц - аграсовых клещей (Acari: Argasidae) в Азербайджане, Туркменистане и Узбекистане

Аннотация:

Вирус Баку (BAKV - Baku virus) был выделен из клещей Ornithodoros capensis Neumann, 1901 (Acari: Argasidae), собранных весной и летом 1970 г. в гнездовье серебристых чаек Larus argentatus на островах Бакинского архипелага в Каспийском море, и отнесен к комплексу вируса Кемерово (KEMV), род Orbivirus сем. Reoviridae. Позднее BAKV многократно изолировали из клещей О. coniceps Canestrini, 1980, собранных в гнездовьях чаек L. argentatus и крачек Sterna hirundo в Туркмении и норовых гнездовьях голубей Columba livia neglecta в предгорьях Чаткальского хребта Западного Тянь-Шаня (Ташкентский район, Узбекистан). В настоящей работе геном прототипного штамма BAKV LEIV-Azn46 был секвенирован de novo с использованием технологии полногеномного секвенирования (next-generation sequencing). Установлено, что белок Pol BAKV имеет 48,6% идентичности с вирусами группы GIV и в среднем 41% с неклещевыми орбивирусами. Идентичность белка Т2 BAKV с орбивирусами составляет от 23,7 до 64,8%. Наибольший уровень (64,8%) идентичности по белку Т2 BAKV имеет с клещевыми вирусами группы GIV (KEMV). На основании проведенного молекулярно-генетического и филогенетического анализа показано, что BAKV является новым видом орбивирусов, который формирует отдельную филогенетическую группу, близкую к группе GIV.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2013
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2013.-N 6.-С.22-26. Библ. 16 назв.
Просмотров: 60