НОВЫЕ ПОДХОДЫ К ВЫЯВЛЕНИЮ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЛЕГИОНЕЛЛЕЗА В КЛИНИЧЕСКИХ ОБРАЗЦАХ И ОБЪЕКТАХ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ МЕТОДОМ ПЦР

Аннотация:

Подбор перспективных мишеней для разработки на их основе тест-систем для выявления ДНК легионелл в исследуемом материале в ПЦР с электрофоретическим и гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов. В исследованиях использовали 22 штамма Legionella pneumophila. 3 штамма Legionella spp. и 30 культур гетерологичных микроорганизмов; клинический материал и пробы из объектов окружаюшей среды. Анализ геномов проводили с использованием программы Mega 3.1. Подбор праймеров осуществляли с помощью программы Primer Express и алгоритма BLAST и зондов формата TaqMan. Проведен анализ 712 нуклеотидных последовательностей легионелл на наличие новых видоспецифичных и консервативных для L. pneumophila локусов. Для анализа были выбраны фрагменты генов жизнеобеспечения: fliC, mompS, ftsZ, dotA, dnaX, trpS, rpоВ, rnp, proA, gspA. Установлено, что наиболее перспективными ДНК-мишенями являются гены ftsZ и mompS. На основе выбранных локусов сконструированы ПЦРтест-системы для выявления ДНК возбудителя легионеллеза в биологическом материале и объектах окружающей среды, охарактеризована их диагностическая ценность. Проведенные исследования показали перспективность использования генов жизнеобеспечения ftsZ и mompS для конструирования новых препаратов для генной диагностики легионеллеза.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2013
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2013.-N 6.-С.94-99. Библ. 13 назв.
Просмотров: 47