УЧАСТКИ СВЯЗЫВАНИЯ PurR. КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ РЕГУЛЯТОРНЫХ СИГНАЛОВ В ПОЛНЫХ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОМАХ.

Аннотация:

Распознавание участков регуляции транскрипции - одна из самых сложных проблем вычислительной молекулярной биологии. Небольшой размер выборок и малая консервативность сигнала в большинстве случаев не позволяют построить абсолютно достоверного распознающего правила. В настоящей работе предложен новый подход к этой проблеме, основанный на одновременном анализе нескольких родственных геномов. При этом предполагается эволюционная стабильность групп генов, находящихся под общей регуляцией. Тем самым, составив для каждого генома выборку генов, в регуляторных областях которых обнаруживаются предполагаемые сигналы, и выбрав среди этих генов родственные семейства, можно надежно предсказывать наличие для этих семейств рассматриваемой регуляции. Этот подход применен к анализу генов, кодирующих ферменты синтеза пуринов в Escherichia coli и Haemophilus influenzae. Транскрипция этих генов регулируется белком PurR. Впервые идентифицированы участки связывания PurR в геноме Н. influenzae, а также новое семейство транспортных белков Е. coli и Н. influemae, регулируемых PurR.

Авторы:

Издание: Молекулярная биология
Год издания: 1999
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 1999.-N 1.-С.127-132
Просмотров: 24