МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ДОКИНГ И 3D-QSAR ПРОИЗВОДНЫХ 16альфа,17альфа-ЦИКЛОАЛКАНОПРОГЕСТЕРОНА КАК ЛИГАНДОВ РЕЦЕПТОРА ПРОГЕСТЕРОНА

Аннотация:

По данным о 42 стероидах ряда прегна-D'-пентаранов был построен набор моделей, предсказывающих аффинность лигандов к рецептору прогестерона. Наилучший результат (Q2=0,91) был получен при использовании комбинации методов молекулярного докинга, симуляции молекулярной динамики и искусственных нейронных сетей. Хорошая предсказательная сила этой модели была подтверждена на группе из 8 синтезированных отдельно и проверенных in vitro пентаранов (R2 тестирования равно 0,77). Эту модель можно использовать для определения степени сродства лиганда к рецептору и точного ранжирования соединений по связыванию. Существуют реальные предпосылки для совершенствования стероидных аналогов прогестерона, которые находят широкое применение в контрацепции, заместительной терапии и как противоопухолевые препараты. Во-первых, к настоящему времени получено и испытано довольно много соединений этого типа, что позволяет рассчитывать на выявление количественных корреляций между структурой и биологической активностью (QSAR). И такие работы на отдельных гомологичных рядах прогестинов успешно проведены. Во-вторых, в 1998 г. методом рентгеноструктурного анализа (РСА) была установлена пространственная структура комплекса прогестерона с лиганд-связывающим доменом (ЛС-доменом) рецептора прогестерона (РП) человека, благодаря чему возникла возможность прогнозировать взаимодействие проектируемых аналогов с участком связывания вплоть до прямого моделирования комплексов белок - проектируемый лиганд. И, наконец, в-третьих, конформационная ригидность стероидных прогестинов упрощает сопоставление их молекул и позволяет рассчитывать на структурное сходство их комплексов с рецептором.

Авторы:

Издание: Биомедицинская химия
Год издания: 2013
Объем: 14с.
Дополнительная информация: 2013.-N 6.-С.622-635. Библ. 23 назв.
Просмотров: 51