Генетическая характеристика штаммов вируса Залив Терпения (ZTV - Zaliv Terpeniya virus) (Bunyaviridae, Phlebovirus, антигенный комплекс Укуниеми), изолированного в высоких широтах Северной Евразии из облигатных эктопаразитов чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 и от комаров Culex modestus Ficalbi, 1889 в субтропиках Закавказья

Аннотация:

В работе методом полногеномного секвенирования определены нуклеотидные последовательности генома двух вирусов LEIV-13841Ka (ID GenBank KF767463-65) и LEIV-279Az (ID GenBank KF767460-62), которые на основании филогенетического анализа классифицированы нами как штаммы вируса Залива Терпения (ZTV - Zaliv Terpeniya virus). LEIV-13841Ka изолирован от клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 на острове Арий Камень (Командорские острова) в 1986 г. Второй изученный изолят LEIV-279AZ, по данным первичной серологической идентификации охарактеризованный как вирус Укуниеми (UUKV - Uukuniemi virus), изолирован из комаров Culex modestus Ficalbi, 1889, собранных в августе 1969 г. в колонии цапель (Ardea Linnaeus, 1758) в Азербайджане. Согласно проведенным исследованиям, LEIV-279AZ также является изолятом ZTV. По RdRp LEIV-13841Ka и LEIV-279Az практически гомологичны (99%) ранее секвенированному штамму ZTV/LEIV-271Ka. На нуклеотидном уровне гомология L-сегмента с ZTV/LEIV-271 Ка составляет 94 и 98% для LEIV-13841Ka и LEIV-279AZ, по сегменту М - 89 и 88% соответственно. При этом по аминокислотной последовательности полипротеина Gn/Gc данные значения составляют 98,3 и 97,7%. По белку нуклеокапсида (NP) изученные штаммы ZTV/LEIV-13841Ka и LEIV-279AZ обладают 88,7 и 84,6% гомологии с ZTV/LEIV-271Ка и по аминокислотной и нуклеотидной последовательности соответственно. Таким образом, нами впервые охарактеризован изолят ZTV из субтропической зоны Закавказья, который был изолирован от комаров. Полученные данные позволяют расширить предполагаемый ареал ZTV и дополнить данные об экологии флебовирусов серогруппы Укуниеми и их эволюции.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2014.-N 1.-С.12-18. Библ. 28 назв.
Просмотров: 63