МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ FRANCISELLA TULARENSIS МЕТОДОМ МУЛЬТИЛОКУСНОГО АНАЛИЗА ВАРИАБЕЛЬНОСТИ ЧИСЛА ТАНДЕМНЫХ ПОВТОРОВ

Аннотация:

Представлены результаты молекулярного типирования штаммов вида Francisella tularensis из разных регионов России и территории бывшего Советского Союза методом мультилокусного анализа вариабельности числа тандемных повторов (MLVA) по 25 локусам. Сравнительное исследование штаммов из коллекции «ГКПМ-Оболенск» позволило дифференцировать их на подвиды и определить внутривидовые особенности, связанные с географическим местом выделения. Была определена значимость локусов, варьирование числа повторов в которых дает возможность различать подвиды внутри вида F. tularensis и локусов, с помощью которых дифференцировали штаммы внутри голарктического подвида. Среди 58 изученных штаммов голарктического подвида выявлено 42 генотипа. Ключевые слова: туляремия; Francisella tularensis; гено-типирование, VNTR, MLVA Туляремия - зоонозная природно-очаговая особо опасная инфекция, возбудитель которой F. tularensis инфицирует более 250 видов животных и может передаваться человеку множеством способов - при прямом контакте с зараженным животным, при приеме внутрь контаминированной воды и пищи, аэрогенным путем, а также через укусы клещей, мух и комаров. Систематическое положение возбудителя туляремии следующее: Тип BXII. Proteobacteria, Класс III. "gammaproteobacteria", Порядок V. "Thiotrichales", Семейство III. Francisellaceae, Род I. Francisella. К роду Francisella относят в настоящее время 2 вида: F. tularensis и F. philomiragia. Однако в последнее время появились публикации, в которых изучены заболевания рыб, вызванные новыми видами фран-циселл: Francisella hispaniensis, Francsiella asiatica и Francsiella noatunensis (сем. Francisella piscicida). Сравнение последовательности гена 16S РНК возбудителей данных инфекций показывает 97% гомологии с последовательностью гена 16S РНК Francsiella tularensis и 98% гомологии с последовательностью гена 16S РНК Francsiella philomiragia. Целью данного исследования является генотипи рование штаммов, выделенных на территории бывше го Советского Союза, методом MLVA по 25 локусам.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2014
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2014.-N 1.-С.8-15. Библ. 13 назв.
Просмотров: 98