Таксономия ранее негруппированного вируса Тамды (TAMV - Tamdy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schulce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae) в Средней Азии и Закавказье

Аннотация:

Проведено полногеномное секвенирование (GenBank ID: KF801653-KF801655) трех штаммов вируса Тамды (TAMV - Tamdy), прототипный штамм которого LEIV-1308UZ был впервые изолирован из иксодовых клещей Hyalomma asiaticum asiaticum Schulce et Schlottke, 1929 (Ixodidae, Hyalomminae), собранных в августе 1971 г. с овец в пустынном ландшафте в окрестностях г. Тамдыбулак Тамдинского района Бухарской области Узбекистана. Показано, что TAMV является прототипным представителем новой филогенетической группы в составе рода Nairovirus. Гомология TAMV по аминокислотной последовательности RdRp (L-сегмент) составляет менее 40% с вирусами Крымской-Конго геморрагической лихорадки (CCHFV), Хазара (HAZV) и Дугбе (DUGV), которые тоже связаны с иксодовыми клещами. Уровень гомологии TAMV с вирусами Иссык-Куль (ISKV) и Каспий (CASV) по RdRp составляет 37,6 и 37,7% соответственно. Эти данные соответствуют низким значениям гомологии структурных белков GnGc (М-сегмент) и белка нуклеокапсида N (S-сегмент). Гомология TAMV с наировирусами по GnGc составляет в среднем 25%; с наировирусами, связанными с иксодовыми клещами (CCHFV, DUGV, HAZV), - 33%; с аргасовыми клещами (ISKV, CASV) - 28%.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2014.-N 2.-С.15-22. Библ. 34 назв.
Просмотров: 87