Генетическая характеристика вируса Баткен (BKNV - Batken virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), изолированного из иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844 и комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889 в Средней Азии

Аннотация:

Методом полногеномного секвенирования (MiSeq, lllumina) определена практически полная нуклеотидная последовательность генома вируса Баткен (BKNV - Batken virus) (ID GenBank KJ396672-4). Прототипный штамм LEIV-K306 BKNV изолирован от иксодовых клещей Hyalomma marginatum Koch, 1844, собранных с овец в окрестностях районного центра Баткен в Киргизии в апреле 1970 г. Впоследствии на территории Киргизии BKNV был изолирован из смешанного пула комаров Aedes caspius Pallas, 1771 и Culex hortensis Ficalbi, 1889. Ранее было установлено, что BKNV чрезвычайно близок к вирусу Дхори (DHOV - Dhori virus) (Orthomyxoviridae, Thogotovirus), впервые изолированному от иксодовых клещей Hyalomma dromedarii Koch, 1844 в Индии. В настоящей работе показано, что структурные и неструктурные белки BKNV обладают высоким уровнем гомологии с DHOV - 98% (РВ1) и 96% (РВ2, PA, NP, М). Уровень гомологии поверхностного гликопротеина НА у BKNV и DHOV составляет 90%, что объясняет антигенные различия между этими близкородственными вирусами. Поскольку гомология остальных структурных и неструктурных белков BKNV и DHOV составляет 96-98%, можно заключить, что BKNV является топотипным вариантом DHOV, характерным для Средней Азии, Закавказья и Северного Прикаспия. Эволюционное расхождение BKNV и DHOV по поверхностному гликопротеину, вероятно, связано с локальными экологическими особенностями ареала BKNV.

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2014.-N 2.-С.33-37. Библ. 24 назв.
Просмотров: 77