АЛГОРИТМ ИДЕНТИФИКАЦИИ ТОКСИГЕИНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИ ИЗМЕНЕННЫХ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE БИОВАРА ЭЛЬ ТОР

Аннотация:

Цель. Разработка алгоритма идентификации генетически измененных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор, обеспечивающего установление серогруппы, серовара и биовара исследуемого изолята на основе фено- и генотипических свойств, выявление генетически измененных штаммов возбудителя холеры Эль Тор, их дифференциацию по эпидемическому потенциалу, а также оценку вариабельности ключевых генов патоген-ности. Материалы и методы. Комплексный анализ 28 природных штаммов V. cholerae проводили с помощью традиционных микробиологических методов, ПЦР и фрагментарного секвенирования. Результаты. Разработан алгоритм идентификации токсигенных генетически измененных штаммов V. cholerae биовара Эль Тор, включающий 4 этапа: определение серогруппы, серовара и биовара на основе фенотипических свойств, подтверждение серогруппы и биовара на основе молекулярно-генетических свойств, определение принадлежности штаммов к генетически измененным, дифференциация генетически измененных штаммов по их эпидем ическому потенциалу и выявление полиморфизма ключевых генов патогенности ctxB и tcpA. Алгоритм основан на использовании традиционных микробиологических методов, ПЦР и секвенирования фрагментов генов. Заключение. Применение разработанного алгоритма повысит эффективность выявления генетически измененных вариантов возбудителя холеры Эль Тор, их дифференциацию по эпидемическому потенциалу и обеспечит установление полиморфизма генов, кодирующих ключевые факторы патогенности, для выяснения источника происхождения штаммов и возможных путей заноса инфекции.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2014
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2014.-N 2.-С.36-46. Библ. 11 назв.
Просмотров: 56