СРАВНИТЕЛЬНЫЙ МУЛЬТИЛОКУСНЫЙ VNTR- И SNP-АНАЛИЗ ВАКЦИННЫХ ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS

Аннотация:

Сибирская язва относится к группе особо опасных инфекционных болезней, общих для человека и животных, с потенциальной возможностью использования возбудителя данного заболевания, Bacillus anthracis, для биотеррористических целей. Поэтому каждый случай заболевания людей и/или животных с подозрением на сибирскую язву требует особого внимания и эпидемиологического расследования, основанного на результатах лабораторного анализа. Лабораторное подтверждение диагноза сибирской язвы относится к ключевым факторам, определяющим необходимость проведения комплекса противоэпизоотических, противоэпидемических и профилактических мероприятий, направленных на выявление путей и факторов передачи инфекции, локализацию и ликвидацию очага сибиреязвенной инфекции, а также предотвращение дальнейшего распространения возбудителя. При лабораторном исследовании штаммов В. anthracis в качестве дополнительного метода применяется молекулярно-генетическое MLVA-типирование, позволяющее установить принадлежность выделенных культур возбудителя к определенному генотипу. Сравнительный анализ генотипов исследуемых штаммов не только открывает возможность выявления или подтверждения предполагаемого источника инфекции, путей и факторов передачи, но и дает возможность значительно расширить объективные данные о биологических особенностях конкретного изолята возбудителя. Большое значение имеет возможность дифференциации с помощью генотипирования вакцинных штаммов, применяемых в клинической практике и ветеринарии, от полевых, в том числе и атипичных, при исследовании материала с подозрением на контаминацию возбудителем сибирской язвы, в случаях сибиреязвенных эпизоотий, а также для исключения случаев внутрилабораторной контаминации исследуемых образцов. В связи с вышеизложенным в последние годы как у нас в стране, так и за рубежом растет число публикаций, посвященных различным аспектам генотипирования сибиреязвенного микроба, в том числе и вакцинных штаммов. Однако в зарубежных работах встречается информация только об одном штамме российского происхождения — СТИ-1. Российские исследователи, изучившие генотипы 5 известных вакцинных штаммов, пришли к заключению, что использование данных о структуре VNTR-генотипов по 18 вариабельным локусам хромосомной локализации оказывается недостаточным для дифференциации вакцинных штаммов В. anthracis 55 ВНИИВВиМ и СТИ-1. В представленной работе для расширенной молекулярно-генетической характеристики вакцинных штаммов с целью их идентификации и дифференциации нами был выполнен анализ вариабельности 15 VNTRлокусов, а также изучены дополнительные генетические детерминанты и 12 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), для детекции которых впервые был применен новый методический подход и разработана система оригинальных олигонуклеотидных зондов.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2014
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2014.-N 2.-С.36-40. Библ. 15 назв.
Просмотров: 120