Таксономия ранее не классифицированного вируса Чим (CHIMV - Chim virus) (Bunyaviridae, Nairovirus, группа Кальюб), изолированного в Узбекистане и Казахстане из иксодовых (Acari: Ixodidae) и аргасовых (Acari: Argasidae) клещей, собранных в норах больших песчанок Rliombomys opimus Lichtenstein, 1823 (Muridae, Gerbillinae)

Аннотация:

В работе методом полногеномного секвенирования de novo определена полная последовательность генома (ID GenBank: KF801656) прототипного штамма LEIV-858Uz вируса Чим (CHIMV - Chim virus), изолированного от клещей Ornithodoros tartakovskyiOlenev, 1931, собранных в июле 1971 г. в норах большой песчанки (Rhom-bomys opimus Lichtenstein, 1823) в окрестностях поселка Чим Кашкадарьинской области Узбекистана. Позднее еще четыре штамма CHIMV были изолированы от О. tartakovskyi, О. papillipes Birula, 1895, Rhipicephalus turanicus Pomerantsev, 1936, собранных в норах больших песчанок в Кашкадарьинской, Бухарской, Сыр-дарьинской областях Узбекистана, и три штамма - от иксодовых клещей Hyalomma asiaticum Schulze et Schlottke, 1930 из нор большой песчанки в Джезказганской области Казахстана. Вирус потенциально патогенен для людей и верблюдов. На основании проведенного филогенетического анализа показано, что CHIMV является новым вирусом рода Nairovirus (Bunyaviridae). CHIMV филогенетически наиболее близок к вирусу Кальюб (QYBV - Qalyub virus) - прототипному представителю одноименной группы. CHIMV с QYBV обладает до 87% гомологии по аминокислотной последовательности каталитического центра RdRp (L-сегмент). Эти данные согласуются с тем, что вирусы группы QYBV так же, как и CHIMV, экологически связаны с клещами рода Ornithodoros и норовыми грызунами. С другими наировирусами CHIMV имеет 30-40% гомологии по аминокислотной последовательности полипротеина предшественника оболочечных белков GnGc (М-сегмент). По белку нуклеокапсида N (S-сегмент) данное значение составляет в среднем 50%. Полученные данные позволяют отнести CHIMV к группе QYBV в составе рода Nairovirus (Bunyaviridae).

Авторы:

Издание: Вопросы вирусологии
Год издания: 2014
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2014.-N 3.-С.18-23. Библ. 27 назв.
Просмотров: 53