СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ УЧАСТКОВ ГЕНОМА, СВЯЗАННЫХ С ВИРУЛЕНТНОСТЬЮ, У ПРИРОДНЫХ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE КЛАССИЧЕСКОГО И ЭЛЬ ТОР-БИОВАРОВ

Аннотация:

Методами ПЦР и фрагментарного секвенирования проведен сравнительный анализ участков генома, связанных с вирулентностью, у различных штаммов V. cholerae: классического биовара, а также типичных и генетически измененных штаммов биовара Эль Тор. Показано, что геном V. cholerae классического биовара более стабилен по сравнению с таковым V. cholerae Эль Тор. Установлено присутствие в геноме Эль Тор-вибрионов протяженных вариабельных участков, несущих гены патогенности. Обнаружено также, что в отличие от классических холерных вибрионов в геноме возбудителя холеры Эль Тор отсутствует CRISPR-система, ограничивающая горизонтальный перенос генов. Выявленные особенности структуры генома V. cholerae Эль Тор могут быть использованы для разработки нового поколения генодиагностических препаратов, а также для совершенствования молекулярно-эпидемиологического мониторинга при холере. Холера - особо опасная инфекционная болезнь, которая приводит к серьезному экономическому и социальному ущербу. Число больных холерой за последние 10 лет (2003-2012) составляет свыше 2 200 000 человек. Возбудителем холеры являются Vibrio cholerae 01- и 0139-серогрупп. Холерные вибрионы 01 серогруппы представлены двумя биоварами, отличающимися друг от друга по фенотипическим и генетическим свойствам: классическим, вызвавшим, видимо, первые шесть пандемий холеры, и биоваром Эль Тор, являющимся возбудителем текущей седьмой пандемии. За время эволюции возбудитель холеры Эль Тор претерпел значительные изменения, чему во многом способствовало присутствие в его геноме значительного количества мобильных генетических элементов (МГЭ), таких как профаги (СТХср и RSl(p), острова патогенности (VPI-1 и VPI-2), пандемичности (VSP-I и VSP-II) и персистенции (EPI), интегронный остров, а также транспозоны и IS-элементы. Благодаря пластичности генома возбудитель холеры способен обитать в различных экологических нишах - в организме человека и водной среде. Кроме того, присутствие МГЭ делает геном V. cholerae нестабильным, что проявляется в утрате и/ или приобретении новой генетической информации, включая гены вирулентности.

Авторы:

Издание: Эпидемиология и инфекционные болезни
Год издания: 2014
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2014.-N 2.-С.26-33. Библ. 24 назв.
Просмотров: 72