ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ХАРАКТЕРИСТИКА SlVKOR -БЕЛКА ИЗ ТОМАТОВ (Solatium lycopersicum), СИНТЕЗИРУЮЩЕГО ДИСУЛЬФИДНЫЕ СВЯЗИ. БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ VKOR РАСТЕНИЙ

Аннотация:

Белки-гомологи эпоксид-редуктазы витамина К (VKOR) широко представлены в тканях растений, но до сих пор изучается лишь VKOR из Arabidopsis thaliana. В представленной работе была клонирована последовательность кодирующего района VKOR из Solanum lycopersicum (JF951971 в GenBank). Ей соответствовал белок (SlVKOR), состоящий из трансмембранного домена VKOR и дополнительного немембранного тиоредоксин (Тгх)-подобного домена. Анализ, выполненный с использованием методов биоинформатики, показал, что первые 47 N-концевых аминокислот молекулы белка SlVKOR функционируют в качестве транзитного пептида, позиционирующего этот белок в хлоропластах. Методом вестерн-блоттинга было показано, что SlVKOR локализован в мембране тилакоидов, причем его Trx-домен расположен на их освещенной поверхности. Моделирование трехмерной структуры SlVKOR показало, что его конформация аналогична конформации VKOR из Arabidopsis и цианобактерий: пять трансмембранных сегментов VKOR-домена и типичный Тrх-подобный домен на освещенной стороне. Результаты функционального анализа свидетельствовали о том, что полноразмерный двухдоменный SlVKOR, лишенный транзитного пептида, мог катализировать реакцию синтеза дисульфидных связей. Сходные по структуре N-концевые транзитные пептиды выявлены и в других белках VKOR растений, причем, в соответствии с нашим прогнозом, мишени большинства из них находятся в хлоропластах. Сравнение аминокислотных последовательностей и структур белков VKOR из различных растений показало, что все они состоят из двух доменов: трансмембранного VKOR и немембранного Trx-подобного, каждый из которых содержит по четыре консервативных остатка цистеина. Сделанный нами прогноз позволяет отнести эти Cys к функциональным, участвующим в реакции синтеза внутримолекулярных дисульфидных связей в белках-субстратах.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2014
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2014.-N 5.-С.560-571. Библ. 26 назв.
Просмотров: 58